Đã hơn 15 năm kể từ ngày thành lập, Khu kinh tế Vân Phong vẫn chưa thể trở thành “đầu tàu” thu hút đầu tư, cũng như chưa tạo động lực phát triển kinh tế-xã hội của tỉnh Khánh Hòa và khu vực. Hiện nay, Khu kinh tế Vân Phong đang được điều chỉnh quy hoạch chung, hướng tới mục tiêu trở thành trung tâm của khu vực duyên hải Nam Trung Bộ, Tây Nguyên và cả nước.